En el SAT se combinan una serie de características de orden conceptual y práctico que le dan carácter de innovación educativa:

• El SAT despierta en el alumno un interés muy grande por la investigación, lo que lo induce a estudiar a fondo los problemas de su comunidad y a apoyarse en la ciencia para irles buscando soluciones con alta motivación y compromiso.
• Se integran constantemente la teoría con la práctica, rescatando de esta manera el verdadero papel de la escuela frente a la comunidad.
• Se genera una armoniosa fusión de saberes, del saber tradicional con el conocimiento moderno.
• Se integran actividades abstractas con actividades concretas.
• Se integran áreas del conocimiento, cuando la capacidad o actitud que se trate de ayudar a fortalecer en el alumno lo requieran.
• Se busca fundir en una sola, la dimensión intelectual del hombre con su dimensión espiritual, una espiritualidad que se refleja constantemente en la práctica de valores humanos universales, y en la participación activa en la búsqueda y construcción de una sociedad mejor.
• Las relaciones pedagógicas no son las tradicionales sino las de un grupo de personas que trabajan juntas en pos de un objetivo común. Estudiantes y tutor desafían juntos problemas concretos y enfrentan un estilo de encuentro que abre el camino al autoaprendizaje.
• Al interior del grupo SAT, que es al mismo tiempo un grupo de vecinos que comparten posibilidades y problemas, aprender a dialogar es tanto objetivo educativo como medio de formación. 
• Al ser tutorial permite que el estudiante avance a su propio ritmo – por lo tanto, es abierto y flexible.
• El tutor pertenece a la misma comunidad o región. Es mayor su compromiso y conocimiento de la realidad.
• El Sistema facilita que el estudiante no tenga que desplazarse largas distancias ni desligarse de su medio socio-cultural.
• Integra el estudio con el trabajo y la promoción de la comunidad, con espíritu de servicio.
• Dispone de textos propios, fruto de procesos de investigación-acción sobre la realidad rural.
• Son textos elaborados para que el estudiante, con la guía de su tutor, se comprometa en un proceso de validación del conocimiento y de construcción de conocimientos nuevos.
• Es fácilmente apropiable por otras organizaciones con misiones similares a las de FUNDAEC, las cuales gestionan su incorporación a los programas gubernamentales de mejoramiento de la calidad y ampliación de cobertura.
• No requiere para su funcionamiento de una gran infraestructura. Se aprovechan las instalaciones físicas existentes en las comunidades.
• La manera como está organizado el Sistema, además de responder a la urgencia de ampliar la cobertura y de restituirles a las poblaciones el derecho a una educación apropiada de alta calidad, mantiene los costos del programa por debajo de los estándares de costo por estudiante.